文部科学省との緊密な連携のもとに行う、国の特別支援教育政策の推進に寄与する研究。 各障害種別を通じて、国の重要な政策課題の推進に寄与する研究（原則５年間）。

• 我が国におけるインクルーシブ教育システムの構築に関する総合的研究－地域と学校での主体的取組を支援する「インクルCOMPASS」の提案－
  （令和２年度）
• 特別支援教育における教育課程に関する総合的研究－新学習指導要領に基づく教育課程の編成・実施に向むけた現状と課題－
  （平成３０～令和２年度）